Die Durchführung von Projekten ist ein wesentlicher Bestandteil der Arbeit im Bereich der Gedenkstättenförderung Niedersachsen. Dazu zählen vor allem Forschungsvorhaben, Ausstellungsprojekte, Publikationen, Tagungen, pädagogische Maßnahmen oder die Entwicklung von Gedenkstättenkonzepten.

Zur Zeit führt die Stiftung ein Forschungsprojekt zum „Arbeitseinsatz der sowjetischen Kriegsgefangenen auf dem Gebiet des Landes Niedersachsen“ durch, das vom Niedersächsischen Ministerium für Wissenschaft und Kultur gefördert wird, und ein Projekt zur Erschließung der Gefangenenakten des Zuchthauses Hameln in der NS-Zeit durch.

Oft werden die Vorhaben mit unterschiedlichsten Kooperationspartnern realisiert: Gedenkstätten, Bildungseinrichtungen, Universitäten, Forschungsinstitute, Ministerien und Vereine. Im Bereich Pädagogik ist die Stiftung an der Entwicklung von Bildungsmodulen zur Verfolgung der Sinti und Roma beteiligt.

Die Kooperationen sind häufig grenzübergreifend. Gemeinsam mit der Landeszentrale für politische Bildung Bremen und Vereinen am Ort arbeitet die Stiftung an einem Konzept für den DenkOrt Bunker Valentin bzw. für die Rüstungslandschaft-Farge/Schwanewede, die auf dem Gebiet der Bundesländer Bremen und Niedersachsen liegt. Mit Gedenkstätten und Wissenschaftlern im In- und Ausland besteht ein enger Kommunikationszusammenhang im Forschungsbereich Kriegsgefangenenlager der Wehrmacht mit Schwerpunkt sowjetische Kriegsgefangene.